如何把测的DNA序列进行在NCBI上进行blast
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/10/03 04:55:08
很多的软件都可以分析,百度下,武汉淼灵生物
末端终止法测DNA序列即SANGER双脱氧链终止法,其原理是:DNA链中核苷酸以3’,5’-磷酸二酯键连接,合成DNA所用的底物是2’-脱氧核苷三磷酸.2’,3’ddNTP与普通dNTP不同,它们在脱
别想了,现在个人的DNA测序很贵的.支付不起的亲再问:���Լ������ǹ�˾�������豸����ֻ��Ҫ��������ô��������再答:�������������������ţ����
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
粘帖你的序列到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast选择你Blast的基因组物种点击即可发给我吧,我给你做
在blastn页面里在Align two or more sequences 前打钩,会出现上下两个窗口,各输一个序列就可以进行比较了.
怎么写的都不清楚大致上说就是为了转录的方便和识别的精确,因此有许多的特征.首先,在转录的上游有GC框,CAAT框,TATA框.在转录区,按三联密码子编码,不同的三联密码子对应20种不同的氨基酸残基.三
这种序列一般就被称为转录调控序列,或者转录前调控序列,大部分位于基因的5'非翻译区.他们的作用主要是结合各种转录因子和翻译原件,也包含TATAbox等特殊序列.转录因子常见的有NFkB系列,AP系列等
一般做一个ORF分析即可,即该序列存在ATG或GTG起始密码子,还有连续的编码区,并且有一个终止密码子TAG,TAA或TAT.对于不同物种的基因还有RBS、TATAbox、CAATbox等元件,现在的
根据密码子逆向推出RNA序列.再根据碱基互补配对原理推出DNA序列.这里你会发现一个氨基酸对应多个密码子,但是这几个密码子前两个氨基酸大多是相同的,在考虑物种的密码子偏爱性,设计一组引物(所有可能的d
先注册登录,然后点击左上角栏目框里的genbank,进入点击左边栏里的searchgenbank,打开后,在搜索栏里键入你需要的序列编号,点击GO,就OK了!
按照碱基互补配对原则,A-UC-GG-CT-A左侧是DNA,右侧是RNA.然后依次写出RNA上的碱基即可.若是计算百分含量,则对一特定碱基,其占DNA双链的比例与对应(与之配对)的RNA所占的比例相等
1.登陆NCBI网站2.在上排找到BLAST,点击进入,我只用过Oldblast,你可以点击Oldblast的连接进入.3.找到Searchforshort,nearlyexactmatches,点击
如果你知道这条序列是什么序列,并找到特定的引物将该特定的序列扩增出来的话就可以测序.
1.先做序列分析.看是编码序列还是非编码序列.如果是编码序列,则看所编码的蛋白质功能.非编码序列,到Google上搜promoterprediction.然后输入你的序列.可以推测该序列作为promo
NCBIblast,看看同源的序列是什么基因和功能,那你这也差不多就是什么基因和功能.
一般来说,RT-PCR的时候很多情况下会不知道模板DNA的序列,可以在Genbank中寻找和你要扩增的物种的亲缘关系较近的物种的同源基因,多找几种,用DNAMAN或其他软件可以比对它们的序列,这样可以
按编码功能分:蛋白质编码序列;rRNA基因、tRNA基因等RNA编码基因;基因间隔区序列、重复序列等非编码序列;其它功能序列,如复制起点、端粒区、转座子元件等.
是绿色荧光蛋白吗?是的话,去NCBI搜索GFP,选择Neucleotide,一般是前两个,你在那堆数据中找CDS(codingsequence)就可以了
在NCBI里检索,genome是DNA序列,CDS是cDNA序列,即与mRNA互补的序列,不包含内含子