如何用BLAST比较两个蛋白质的同源性
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/09/03 15:08:58
抱歉,仿真化学实验室无法做蛋白质性质实验,只可做无机化学实验以及一部分制取小分子有机化合物的实验.
原理:蛋白质+双缩脲试剂→紫色反应
序列比对结果有一个identify参数,identify参数有一个是数值结果,有一个是百分数的结果.是否具有同源性以identify参数的百分数结果为准,如果达到40%或者以上就叫做有同源性,中文就叫
expasy下面有个UniProtKB/Swiss-Prot•proteinsequencedatabase•[more]进入搜索到你想找的蛋白质之后在下面Cross-ref
不太明白你想问什么.用vectorNTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了.若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点.
像绿色荧光蛋白一样,YFP是细胞生物学和分子生物学中一种非常常用的报告基因. 目前,有三种改良的黄色荧光蛋白:citrine,Venus,andYpet.这三种改良的蛋白荧光更亮,更稳定,而且成熟更
问题矛盾,酶本身就是一种蛋白质,如果根据其不同的分子量和电荷数,可将其层析开来.如果这个酶的参数你已经知道,那可以选用HPLC进行分离.
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据
免疫细胞化学(ICC)需要有针对你的目的蛋白的特异性抗体(或者标签抗体),其他的自己去搜protocol吧
通分变成同底
对于气体,原子量越大,密度越大,对于固体也是这样,但固体与气体之间不能这样比较,固体的密度要较大
我靠,你是交大的吧~
对上面这个页面进行一下必要的介绍:BLAST的这个页面主体部分(左面)包括了三部分:BLASTAssembledGenomes、BasicBLAST、SpecializedBLAST.相信大家可以看懂
在数轴上描出表示数的点在右边的点表示的数总比左边的大
从一个一直蛋白质序列开始,通过tBLASTn工具搜索一个DNA数据库,可以找到相应的匹配,如与DNA编码的已知蛋白质的匹配或者与DNA编码的相关蛋白质的匹配.然后通过BLASTx或BLASTp在蛋白质
加入硫酸铜,冻住了就是有,蛋白变性了凝固
Ksp是难溶电解质的溶度积常数,是用于难溶电解质的,并且用Ksp比较难溶电解质的溶解度大小时要注意物质的结构相似这一点,否则不能直接用来比较.如AgCl与AgBr可用Ksp比较,AgCl与Ag2Co3
y1=[3,4,5,6,2,3,4,5];y2=[4,3,2,6,3,2,2,5];plot(y1,'bo-');holdon;plot(y2,'ro-');axis(
public class Hello {public static void main(String[] args)
BLAST对一条或多条序列(可以是任何形式的序列)在一个或多个核酸或蛋白序列库中进行比对.BLAST还能发现具有缺口的能比对上的序列.BLAST是基于Altschul等人在J.Mol.Biol上发表的