已知一段序列,如何查看是否是cDNA
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/08/29 09:37:01
根本上说是已知核苷酸序列.如果序列知道了,它在什么基因上也就知道了(可以通过BLAST搜索的).PCR的过程是这样的,你首先需要化学合成两条短的单链DNA序列,叫引物(可以直接叫一些公司帮你合成),这
从NCBI中下载基因的序列,再用DNASTAR进行比对,那是保守区域!
在NCBI网站上BLAST一下再问:请老师将详细点,我是今天刚开始接触这个,什么都还不懂的!希望老师能够都指点下!再答:ok
这里完全没有算法可言啊,序列的第N位就是生成多项式里面的x^N的系数.此题目也根本用不着迭代,一个简单的循环就可以解决问题;迭代递归什么的反倒多耗内存.再问:不理解。。。求程序~再答:假设你的序列是一
生物信息学方法查找相关物种中的这一转录本的序列,然后根据保守序列设计兼并引物.提取转录这种转录本的细胞中的RNA,在利用引物扩增出CDNA.这样就获得了这样转录本的全长.
据我所知,高中生物不要求背诵密码子表不过既然你问了,我就写在下面甲硫氨酸(起始)谷氨酸丙氨酸半胱氨酸脯氨酸丝氨酸赖氨酸脯氨酸不知道你从哪里摘抄的,没有终止密码子...
应力不知道,但是接触时的过盈量(也就是两接触面重合的尺寸)是可以设置的.在ContactProperties/InitialAdjustment中,Initialpenetration设为Includ
因为你知道一段序列,也不说有多长,感觉最简单就是到NCBI做BLAST,设计引物PCR的话估计不太现实了.基因组测序飞速发展,估计能BLAST到的,然后就好办多了.真核生物要考虑到内含子,略加注意应该
好像用proteinworshop可以看
把这段基因输入设计软件里,调节引物位置,使变性温度在94度,退火温度=Tm-(5到10度)延伸温度72度左右,满足这些条件基本就可以了,当然还要根据实际情况多次实验得到最佳引物.如果你要扩增整个的基因
NCBIblast,看看同源的序列是什么基因和功能,那你这也差不多就是什么基因和功能.
在知道碱基总数的情况下,知道一种碱基含量,就可以知道相对应的碱基的含量,由此可以用碱基总数减去已知碱基数,之后所得结果为另外两种碱基的含量总数.由于碱基的配对性质,所以用减去的结果除以二就可以得到剩余
最简单的办法:用BLAST工具你不知是到蛋白质序列,在NCBI用该蛋白质序列在BLAST数据库,进行blast,可以找出基因序列.或将之转换为cDNA序列.用cDNA去BLAST都能找到你所想要的基因
1.根据密码子或blast确定DNA序列.2.直接合成,或设计引物做PCR.
提出了一种改良的TDT加尾克隆基因5对于基因组测序已经连接载体的PCR是利用已知基因组DNA序列设计的特异引物和载体通用引物进行扩增
和它的DNA序列比对
上NCBI,进blast(干脆把网址也给你吧,http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_PROGRAMS=megaBla
每一种氨基酸都有对应的密码子根据碱基互补配对原则写出信使RNA的核苷酸排列顺序再根据碱基互补配对原则写出DNA的其中一条模板链再用碱基互补配对原则就可以写出DNA的另一条链了
DNA的合成前端必须是有一小段序列,接着这段序列合成,而不能凭空合成.它前面这一小段序列就是你所要有设计的引物,也就是“一段已知目的基因的核苷酸序列”.需要根据你的模板链设计.因此,扩增不同的基因需要
信号肽一定是包含于CDS之中的.你如果知道cDNA序列,那么去ORFfinder找出CDS,然后把CDS翻译为氨基酸序列,提交到信号肽预测程序SignalP,或者AnthePro里预测就行.