怎么用ncbi查miRNA
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/05 14:45:15
在NCBI主页输入要查找的miRNA的名称,alldatabase中选择GENE;在搜索结果中选择目的miRNA,在NCBIreferencesequences(RefSeq)栏中点击目的miRNA的
NCBI没有这样的数据,你可以在CodonUsageDatabase查到相关物种的密码子偏好信息.CodonUsageDatabase数据库用以计算密码子偏好的序列数据都是来自NCBI,也是学术界和工
微小RNAmicro
搜到的序列有些是包含基因所在的染色体片段的,所以很长;有些是该基因的全长序列,包括基因的编码区和非编码区;cds的就是基因的编码区序列.主要看你的目的来选择的.
进入NCBI主页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在第一个下拉菜单Search那一栏中选上gene然后在搜索框中填上基因的名称,还可以加上种属名,如人是Homosapiens以上
一般进入NCBI界面,选择GENE,输入FeSOD,物种名,比如人,homo,查询就可以导出,氨基酸序列也会跟着出来,如果没有,可以通过超链接查找,或者把GENE改成protein,同样查找
www.pubmed.gov搜索框的下拉菜单选Nucleotide,框中输入基因名,点击Search,或按Enter键.
找到一个物种的mRNA序列,用mRNA的序列去进行blast,找同源性高的序列,找不同物种的.就可以了
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
NCBI上一般不会有说明,你需要近其他预测信号肽的网站进行分析比如:
看看下面的资料,
查mRNA的话,在NCBI主页上AllDatabases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧TopO
1打开NCBI主页2左边search里面选择GENE右边的对话框里输入你想要的基因名称3在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homosapiens是人Feliscatus是猫.选择你想要的种属
把两个基因组序列,贴到BLAST里面就可以了
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
一般而言,在NCBI(也就是Entrez数据系统)查基因序列,主要是搜索的NCBI的Genbank数据库的核酸与蛋白质序列,方法见六零六406.由于Genbank起初是一个类似BBS的序列数据库系统,
登陆ncbi主页,选择Gene数据库(不建议选All database),在搜索栏中输入“Sus scrofa domesticus mitochondrion
如果你在NCBI查到一个基因,在summary栏目的下面紧接着就是一个叫做“Genomicregions,transcripts,andproducts”的栏目,是一个图,左侧有蓝色的小字“NM_……
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/进入点右边的protein然后输入你要查的蛋白质在右边有相应物种的,你选择就行,例如如果是人的就是Homosapiens(12)然后就在里面找了
在前面的框里选gene,后面输入金黄色葡萄球菌的英文名和glucan,然后go,就可以了