怎样查不同品种的同一基因的序列呢?
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/10/06 19:13:44
再有:如何找到一个基因的保守性序列.谢谢各位!把不同种生物的这种基因做一个Align,一般会发现以一个区域的同源性很高,这个区域就叫做保守序列.
http://baike.baidu.com/view/2183856.html
除非你的猪的品种很特别,一般查已知的克隆出来的猪的基因就行了,很保守的出现突变或差异的概率很小,如果是扩这段基因的话直接找一个就行,没多大差异,克隆出来了再去测序就知道不同品种间的差异了.
然后选择unigene,搜索没什么好详细的了阿进去那个NCBI的网址,下拉菜单选择unigene,或者gene,nucleotide都可以,然后搜索sod或者superoxidedismutase
NCBI功能详介和使用方法
如果一个基因在不同的个体中出现,编码区DNA序列一样,而仅仅是内含子序列不同,那还是相同的基因,因为外显子是相同的,基因的表达结果与原来相同.
我可以发给你.我有EGFR基因的全部序列再问:谢谢,我想知道怎么查这个的序列。授之以鱼不如授之以渔再答:NCBI上找核酸选项,搜EGFR,在genbank里就有了。看清楚是人的还是鼠的就OK了再问:在
通常是长黄瓜那一段厉害,因为它的新陈代谢要多
核酸序列保守性可以通过UCSC-blat功能或者ncbi-blast功能,前者可以连接到UNIPROT数据库相应蛋白.
一般的引物序列是需要根据你所做的目的基因序列来自行设计的,你所述“F984和R1378”是否是16srRNA上的,通常使用的16srRNA上的引物有以下一些,请参阅:•27f5'AGAG
可以试试blast程序,在主页的右上方
烟草的已经出来了,拟南芥的,水稻的也知道了,上genbank查一下就好,用一些专业软件一对比就出来了
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/进入NCBI,在AllDatabases下输入所要查的基因名称,例如NADPH,点search,会跳出很多信息,点击Nucleotide进入后会
cry1ab/cry1ac
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
KEGG网站更容易,输入基因名,点击othorloggenes查看下拉框即可再问:不行没查到可能是我也不会操作吧再答:1、NCBI选择nucleotide,输入基因名,获得该基因某物种的序列。如果已经
蛋白质是由氨基酸连接并经过加工在空间中形成不同空间结构才产生具有生物功能的蛋白质.也就是说机体在产生蛋白质前是先通过机体在一定时间,一定部位选择性的表达特定基因(mRNA),真核生物编码一种氨基酸都对
上NCBI,进blast(干脆把网址也给你吧,http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_PROGRAMS=megaBla
每一种氨基酸都有对应的密码子根据碱基互补配对原则写出信使RNA的核苷酸排列顺序再根据碱基互补配对原则写出DNA的其中一条模板链再用碱基互补配对原则就可以写出DNA的另一条链了
这是一个已知基因查找位置http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?term=6327