作业帮NCBI上blast结果中Query cover
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/11/08 08:48:51
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
带引号的都是一些数据库中的编号最前面几行是基因的名称染色体位点以及相关的文献的一些信息
1）输入fasta格式序列2）选择核算比对
什么跟什么说的太不清楚饿了只要你需要的那段序列是对的不就行了嘛跟引物序列有啥关系毕竟大部分的PCR引物设计都是在需要的序列两端隔一段距离而且如果你测序是拿PCR引物测的话那前面的几十个碱基都是测不准的
对序列匹配程度进行评分后得出的分值
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考：http://liucheng.name/475/
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考：http://liucheng.name/475/关于Blast的文章:http://liucheng.name/tag/blast/
首先说明,如果想从蛋白质入手找基因序列,由于同源性较低,不推荐这么做,但是你执意如此,不是没有办法,就是成功率比较低.第二,蛋白质N端起始都是M,你检测出的D是因为没有到起始位置,还是蛋白质有后修饰加
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据
直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问：我只是在做我的本科生毕业论文，所以不咋看得懂，我现在主要就是结果那块看不懂，不知道怎么分
先到：选择Nucleotide-nucleotideBLAST(blastn)然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点BLAST!然后按Format!这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个
看性质可以翻译一下在看嘛
PLN是一个缩写词,代表plant,fungal,andalgalsequences,这个词代表GenBank18个子库中的一个.不同的物种序列此处的值会有所不同.18个子库的缩写和全称如下.事实上如
原理很简单后者是前者的子集.chromosome只包含所有已经测序的基因组数据.估计你的序列可能只是在高等生物中保守,所以才会出现选择chromosome数据库时相似数量下降非常多.在做BLAST的时
NCBI对Blast的原理和结果有专业的说明http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/tutorial/Altschul-1.html
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
没事,这个可以,你应该是把设计的上下游引物都进行了比对,前两个比对结果应该就是上游、和下游引物,假设你第一个结果是上游,第二个结果是下游.那么第三个结果也就是下游比对结果,下游结合的位置距离上游、下游
在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18记作3.2E18,即E=Exponent,指数；幂再问：5e-04，即表示5×10^-4。谢谢再答：嗯，对的！
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多