作业帮如何进行BLAST比对?
来源：学生作业帮 编辑：作业帮 分类：综合作业 时间：2024/11/09 04:05:13
如何进行BLAST比对?
急救啊,朋友!本人是新手,获得了未知菌的16Srdna序列后,进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/中进行比对,页面中有BLAST Assembled Genomes和Basic BLAST之分,请教我该进入哪里,我不知道该把序列贴到哪里?
急救啊,朋友!本人是新手,获得了未知菌的16Srdna序列后,进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/中进行比对,页面中有BLAST Assembled Genomes和Basic BLAST之分,请教我该进入哪里,我不知道该把序列贴到哪里?
Basic BLAST
根据需要选一个（见下面）,点击进入就行了.如果你是要确定是哪种菌,就近第一个Blastn.序列粘贴或者导入,其中Choose Search Set中的Database你要选Others (nr etc.).然后点击Blast就行了.如果同源性有99.99%以上的就说明是那个物种里的.
Blastn 核酸序列搜索逐一核酸数据库中的序列
Blastp 蛋白质序列搜索逐一蛋白质数据库中的序列
Blastx 核酸序列翻译成蛋白质序列后和蛋白质数据库中的序列逐一搜索.
Tblastn 蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列翻译后的蛋白质序列逐一比对
TBlastx 核酸序列翻译成蛋白质序列,再和核酸数据库中的核酸序列6框翻译成的蛋白质序列逐一进行比对
根据需要选一个（见下面）,点击进入就行了.如果你是要确定是哪种菌,就近第一个Blastn.序列粘贴或者导入,其中Choose Search Set中的Database你要选Others (nr etc.).然后点击Blast就行了.如果同源性有99.99%以上的就说明是那个物种里的.
Blastn 核酸序列搜索逐一核酸数据库中的序列
Blastp 蛋白质序列搜索逐一蛋白质数据库中的序列
Blastx 核酸序列翻译成蛋白质序列后和蛋白质数据库中的序列逐一搜索.
Tblastn 蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列翻译后的蛋白质序列逐一比对
TBlastx 核酸序列翻译成蛋白质序列,再和核酸数据库中的核酸序列6框翻译成的蛋白质序列逐一进行比对
BLAST 蛋白比对求助
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您好,看到您对“如何用blast比对两个蛋白质序列,看它们之间有多高的同源性 ”问题的回答,想必阁下对两种