用测序的方法检测点突变可靠吗?
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:综合作业 时间:2024/09/29 21:56:36
用测序的方法检测点突变可靠吗?
有的客户想用测序的方法检测点突变体,我们认为该方法可靠性不高.主要有以下两个原因.首先,我们并不清楚突变的序列与正常的序列的比例是多少.测序反应 的信号强度直接与模板的量有关,如果突变的模板所占的比例很少,将直接作为背景噪音了,很难检测出来.只有当测序反应体系中正常的和突变的模板量比较接近 时,才能较可靠地检测到突变体的存在.其次,在同一位置,不同碱基的信号强度一般是不一样的.这样即使突变的模板所占的比较较高时,也不一定能准确检测到 突变的存在.另外,测序仪是设计用来测序正常的碱基序列的,软件在对扫描的结果进行处理时,会尽量提高主峰而将背景信号尽量压低,以得到尽可能好的结果.因此,当某处出现双峰时,测序仪一般会认为信号弱的峰为背景信号,在处理过程中,将弱的峰进一步压低,这样根部不立于突变体的检测.因此认为,用测序的方 法检测突变体的存在不是一个好的方法.--------转自三博远志网站(测序FAQ)
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