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请问pcr产物测序后,如何确定从哪开始是我要的序列呢?

来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:综合作业 时间:2024/10/05 01:04:15
请问pcr产物测序后,如何确定从哪开始是我要的序列呢?
从引物开始呀!
再问: 不用从NCBI上找同一个科的其他种,这个序列吗?
再答: 你是用什么引物做的PCR就从哪开始找到自己的序列,然后将序列提交到NCBI上进行比对,blast一下,会自动比较你的序列和其他种的相似性的。
再问: 我还是不太明白,不好意思啊,再问一下:是从DNA测序结果中找我用的引物序列么?找到后,从引物开始,就是我要的序列,是这个意思吗?
再答: 对呀,因为你的序列是PCR得到的,那么序列的两端肯定是引物序列呀。
再问: 你能将过程给我细讲一下吗,我没有做过,不知道怎么弄,我刚才看了一下测序结果,找不到引物序列啊
再答: 应该能够找到引物序列,如果一端找不到就到另一端找,如果还是找不到,就用引物的互补序列找。再找不到我就不清楚了。 另外,如果你的目的就是去blast的话,可以直接将测序结果在NCBI上Blast,我记得blast会自动将序列两端不需要的序列去掉的。很久没做过了,我也记不太清了。