我要做转录组测序和功能蛋白的基因,有什么好书或者建议?
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:生物作业 时间:2024/08/23 12:20:22
我要做转录组测序和功能蛋白的基因,有什么好书或者建议?
目前研究转录组主要包含三种方法:
包括基于Sanger测序法的SAGE (serial analysis of gene
expression)、LongSAGE和MPSS(massively parallel signature
sequencing);
基于杂交技术的cDNA芯片和寡聚核苷酸芯片;
基于高通量测序技术的转录组测序(RNA-Seq).
与另两种方法相比,RNA-
Seq具有以下优势:
高灵敏度,检测阈值跨越6个数量级,能检测到细胞中几乎所有的转录本,包括一些只有几个拷贝的稀有转录本,同时能对转录本进行定量;
高准确率,能准确的测定每个转录本的单核苷酸,同时不存在生物芯片的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音的问题;
应用范围广,无需预先设计探针或了解物种的基因信息,即可对任意物种进行转录组测序,同时能发现新的转录本,预测新的基因,检测可变剪切、SNPs、融合
基因等.
所以如果阁下希望进行转录组研究,可以从以上几种方法入手.多看文献,多向前辈请教,假以时日,会成为高手的.如有问题,可以进一步追问.
希望采纳哦
\x09
包括基于Sanger测序法的SAGE (serial analysis of gene
expression)、LongSAGE和MPSS(massively parallel signature
sequencing);
基于杂交技术的cDNA芯片和寡聚核苷酸芯片;
基于高通量测序技术的转录组测序(RNA-Seq).
与另两种方法相比,RNA-
Seq具有以下优势:
高灵敏度,检测阈值跨越6个数量级,能检测到细胞中几乎所有的转录本,包括一些只有几个拷贝的稀有转录本,同时能对转录本进行定量;
高准确率,能准确的测定每个转录本的单核苷酸,同时不存在生物芯片的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音的问题;
应用范围广,无需预先设计探针或了解物种的基因信息,即可对任意物种进行转录组测序,同时能发现新的转录本,预测新的基因,检测可变剪切、SNPs、融合
基因等.
所以如果阁下希望进行转录组研究,可以从以上几种方法入手.多看文献,多向前辈请教,假以时日,会成为高手的.如有问题,可以进一步追问.
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