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基因测序中的kmer是什么意思
来源:学生作业帮 编辑:
作业帮
分类:
生物作业
时间:2024/07/05 23:08:37
基因测序中的kmer是什么意思
k-mer指的是将一条read,连续切割,挨个碱基划动得到的一序列长度为K的核苷酸序列.
比如以下这条read:
ATCGTTGCTTAATGACGTCAGTCGAATGCGATGACGTGACTGACTG
如果是13-mer分析的话
ATCGTTGCTTAAT
TCGTTGCTTAATG
CGTTGCTTAATGA
GTTGCTTAATGAC
……
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