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基因工程方面的问题我现在有一段基因,全长是427bp,是平末端,但是我想在它上面加上酶切位点,也就是说转化成粘性末端,比

来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:生物作业 时间:2024/11/08 03:54:04
基因工程方面的问题
我现在有一段基因,全长是427bp,是平末端,但是我想在它上面加上酶切位点,也就是说转化成粘性末端,比如加上ecol 1和hind 3 ,因为我要和带有这连个酶切位点的载体连接,我该怎么连接,怎么在这段基因上加这连个酶切位点,一个个的加吗?还是同时加?用什么样的试剂,请高手指点,谢谢了.我的这段基因是纯粹的目的基因,因为设计引物的时候加入酶切位点扩的话就会扩不出来,所以只好等扩出来以后再想办法了,现在是目的基因得到了,但是不知道怎么把它转化为粘性的末端了.
感谢高手的回答,我的基因已经做了ta克隆了,原因是为了测序,现在我遇到的难题是这样的,我要做t7噬菌体肽文库,这个载体上就只有RcoRI和HindIII酶切位点 ,而我的目的片段怎么才能插进去呢?如果用ta克隆的话用载体上的酶切位点的话,对后继的工作肯定影响很大,比如抗原性的表达我觉得会很麻烦的,现在就是希望有没有一种试剂在我的目的片段上给我加上酶切位点,比如把我的片段给我修饰一下的东西?
补充回答:
看了楼主的问题补充,据此给一个补充回答:建议以现有TA克隆的质粒为模板,用两端分别带有EoRI和HindIII酶切位点的目的基因特异性引物再次PCR扩增目的基因,此次扩增产物为两边带有酶切位点的目的基因,将其再次TA克隆后,分别EoRI和HindIII双酶切载体和新的TA克隆,做目的构建.不用担心TA载体上自有的EoRI和HindIII切点,因为离目的基因最近的“一刀”是引物上的切点,产生的目的基因片断不会带有TA载体上的序列的.试试看吧,听起来似乎麻烦,做起来很容易的.
你要实在嫌麻烦,可以以你现有的TA克隆为模板,在目的基因两端特定位点分别做点突变而产生EoRI和HindIII切点,点突变直接买试剂盒,合好引物按照说明书来做就行了,做完了别忘测序确证一下.
下面我原来给这两个建议在平时构建实验中也是很有用的:
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我有两个方法建议给你:
1、同意楼上的建议先做TA克隆,但是不建议用TA克隆上的切点.因为如果如楼主所说“这段基因是纯粹的目的基因”的话,就涉及到后续做表达载体时要考虑读码框的问题.我的建议,先做TA克隆,再以TA克隆的质粒为模板,用带有合适酶切位点的引物去做PCR扩增,扩增产物再次TA克隆后,酶切构建.(注:不建议直接酶切PCR产物,很难切且难以判断是否成功酶切).
2、另外一个不用引入酶切位点的建议:按构建设计去酶切目的构建的基本载体,用klenow大片段补平载体的粘性末端,然后用连接酶直接与平末端目的基因做连接,再在阳性克隆中筛选目的基因插入方向正确的目的克隆.这个方法构建比较容易做,后续目的克隆筛选可以选一个载体上的引物和一个目的基因上的引物配对PCR,以此判定阳性克隆中目的片段的插入方向.