rnaseq做snp检测的时候,为什么会检测到基因间区域的
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:生物作业 时间:2024/09/14 03:43:31
rnaseq做snp检测的时候,为什么会检测到基因间区域的
样品制备过程不纯
用的算法不可靠.目前常用的算法,例如Bowtie,BWA,错误率都比较高,大概3%的错误mapping率.更有甚者Novoalign等算法错误率可高达百分之十几.用超高精度比对算法如FANSe/FANSe2会好得多,但对短reads仍然不可能做到100%正确,错误率可以控制在在1%以下.
测序仪操作不好,测序质量差.注意Illumina的测序仪会谎报Phred quality,故意报高让你以为质量很好.
有基因发生重排的现象.
某些长链非编码RNA(lncRNA)也带有polyA尾巴,在RNA-seq时也会被测序到.
用的算法不可靠.目前常用的算法,例如Bowtie,BWA,错误率都比较高,大概3%的错误mapping率.更有甚者Novoalign等算法错误率可高达百分之十几.用超高精度比对算法如FANSe/FANSe2会好得多,但对短reads仍然不可能做到100%正确,错误率可以控制在在1%以下.
测序仪操作不好,测序质量差.注意Illumina的测序仪会谎报Phred quality,故意报高让你以为质量很好.
有基因发生重排的现象.
某些长链非编码RNA(lncRNA)也带有polyA尾巴,在RNA-seq时也会被测序到.
为什么做基因检测?
为什么要做基因检测?
PCR为什么能检测基因的多样性
为什么检测目的基因是否转录出mRNA用标记的目的基因做探针?
联合基因集团有没有做基因检测的资质?
检测目的基因如果很多材料中可能都含有同一个基因,但是不同材料中此基因的序列有微小差异,即存在SNP位点,现在要检测这些材
基因检测的意义是什么?
基因工程目的基因的检测
DNA探针检测法的原理是什么 他是怎样检测到目的基因的
目的基因的表达为什么不直接检测它的表达,而是要先检测标记基因的表达
温湿度计的检测区域范围是多少
隔离变压器作用?到现场做试验的时候,我们的检测仪电源不用隔离变压器而直接接220V交流电,检测时干扰很大,用隔离变压器后