为什么pcr需要上下游两个引物各有什么作用
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/09 02:46:55
因为DNA聚合时需要3‘OH,这个只能由引物提供(没原因,就因为是那样).这个引物是一小段RNA,引物绝对是RNA,而不是DNA.看看DNA复制需要什么酶就知道了,需要依赖DNA的RNA聚合酶(DDR
你理解的没错.上下游引物同时用才能特异性扩增中间的那部分片段.
那是一对引物,通常所说的正向,反向.他们的碱基不一样,当然Tm值也就不一样了.所以设计引物时尽量设计一术的Tm值,有利于选择最佳的退火温度.
什么跟什么说的太不清楚饿了只要你需要的那段序列是对的不就行了嘛跟引物序列有啥关系毕竟大部分的PCR引物设计都是在需要的序列两端隔一段距离而且如果你测序是拿PCR引物测的话那前面的几十个碱基都是测不准的
不需要复制,引物是配比好的,请看PCR的原理.
DNA复制的引物是一小段RNA,由引发酶合成.由于DNA聚合酶不能从头合成,所以必须先由一段RNA引导,在复制完成后除去,再用DNA代替.当然,在另外一些DNA复制模型中,末端的茎环结构也可以引导DN
上游:5ggaattcatgtttagtttgaaaaaaac3下游:5gggttcgaattagacattgccaacatatt3你要的并不是鉴定引物,而是扩增引物根本不用软件
为了形象,不写ATCG,换个比较容易看懂的形式模板是:abcd123.456efgh上游引物是:987ABCD123下游引物是:456EFGH789(这里为了方便观察下游印务给出了3’-5‘形式,通常
Tm值本来就是人为定的一个预测值,三个Tm值代表的是不同的计算方法,常用的是第三种2*AT+4GC.看退火温度时,酶切位点和保护碱基一般是不考虑在内的,因为pcr扩增时这段序列一般是不跟模板结合的,所
个人推荐使用PrimerPremier5
上游引物:GAATTCacgcgcaagattagg(后面可以继续加几个碱基,用PRIMER5.0看一下,引物设计多少个碱基合适,每个基因序列不同.我用TOYOBO的KODPLUS的话,就一般引物设计
不,需要两条,因为随着你PCR的进行,另一条互补链会被引物扩增出来,因此你需要两条引物都加进去.再问:那么我引物设计的时候,是不是以mRNA为模版与以CDNA为模版设计的引物都可以?再答:都可以,别忘
博凌科为-为你上下游温度很接近啊,45度,上下5度,0.2每个梯度.或者直接用47度P
PCR反应第一步DNA双链变性逐步打开,第二部退火时两个引物各自与其互补链的5‘端通过碱基互补结合,并在第三步延伸反应时在引物的3’端不断加上新的碱基从而不断向前延长.每个引物的作用都一样.用上上下游
可以在引物上添加不配对的碱基,但是在引物的3‘端,至少有三个碱基是严格配对的.但是这样的操作主要是为了添加酶切位点或者flag等.Tm值是根据两条链的退火情况来计算,不配对的碱基不算在内,所以你添加不
引物有一条和模版的序列相同,而另一条和模版的序列反向互补,上游和下游是自己定的,分别位于模版的两端
这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握
一般认为Tm-5度.但是要看你的Tm计算方法,不同公司合成的引物得出的Tm都不一样,你可以做个梯度PCR看看最适退火温度,以后就有经验了.
没错,DNA的两条连是互补的,但是引物绝对不可以互补.引物是放在DNA两条连的各一端引导游离DNA上DNA链,不仅不可以互补,还要尽可能的不同.