引物blast结果分析E value什么作用

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/18 05:07:24
关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题

ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection(nr/nt)选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问:这一

怎样用primer-blast设计引物

怎样用primer-blast设计引物http://wangyufeng222.blog.163.com/blog/static/128222070201110511213331/

请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗?

什么跟什么说的太不清楚饿了只要你需要的那段序列是对的不就行了嘛跟引物序列有啥关系毕竟大部分的PCR引物设计都是在需要的序列两端隔一段距离而且如果你测序是拿PCR引物测的话那前面的几十个碱基都是测不准的

请问NCBI dna BLAST结果中Max score、Total score、E value、Query Cover

NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考:http://liucheng.name/475/

怎样用 NCBI/blast 做蛋白质同源性分析

将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据

英语句子成分分析问题The blast occurred a day after the area was hit by

Theblast主语,爆炸;occurred谓语,发生;adayaftertheareawashitbyapowerfulearthquakeandtsunami长的时间状语,其中after后面接了一

Eval 和 DataBinder.Eval(Container.DataItem,"")的区别

一个是绑定变量,一个是绑定记录集.

NCBI:blast的结果中的Max score、Total score、Query coverage、E value、

NCBI对Blast的原理和结果有专业的说明http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/tutorial/Altschul-1.html

ncbi蛋白blast结果

+号表示的是相似性质的氨基酸残基.

PCR引物blast结果,

没事,这个可以,你应该是把设计的上下游引物都进行了比对,前两个比对结果应该就是上游、和下游引物,假设你第一个结果是上游,第二个结果是下游.那么第三个结果也就是下游比对结果,下游结合的位置距离上游、下游

测序结果怎么找不到我的扩增引物序列?

对于这种情况,如果你只是找不到扩增引物的序列,但是能找到后面所要扩增的序列的话,那么可能还是因为测序引物离你的扩增片断太近.如果不是这种情况,那么可能是你根本没有将扩增片断成功连入当然还有一种可能是公

逆转录PCR引物,在PUBMED上搜文献上找了一个引物,BLAST了一下,结果如下,但是自己不大会分析,求指导~

Tm值太高了.只是逆转录的话,只要能逆转录出来,再用pcr扩就好了,特异性不用太讲究.

在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04什么意思,

在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18记作3.2E18,即E=Exponent,指数;幂再问:5e-04,即表示5×10^-4。谢谢再答:嗯,对的!

如何用blast检测引物序列结果好不好

对上面这个页面进行一下必要的介绍:BLAST的这个页面主体部分(左面)包括了三部分:BLASTAssembledGenomes、BasicBLAST、SpecializedBLAST.相信大家可以看懂

已知基因序列,mrna序列,怎样用blast分析内含子和外显子

使用blastn里面的 “Align two or more sequences”,出现两个输入序列的窗口,分别输入基因组序列和mRNA序列,mRNA

基因序列BLAST比对时,Max ident 低于90%,可以做进化分析吗?

可以的,有的基因的同源序列在基因库中很少,一味苛求高的序列相似性是不现实的

tm值与退火温度[求助]我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?我想进行引物的特异

我用primer5设计出来的Tm值从来都是直接当退火温度用.用引物primer-blast的话我都是直接贴序列上去.有其他菌的匹配很正常,有些进化亲缘性很近的,只要在同一物种中没有匹配上的问题应该不大

NCBI中双序列比对BLAST结果相关问题

你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多

【求助】测序结果找不到上下游引物,怎么回事啊?

[color=red][/color]4.28送菌液去某公司测序,昨天收到的测序报告连上下油的引物都找不到.后来我又做了菌落PCR(设阳性,阴性对照)有目的条带.请问各位是什么原因啊?测序结果上不会有

文献上看到一种蛋白,有基因序列号,可是上genbank blast一下,只有它自己,怎么设计引物?

有基因序列号,你就可以直接上genebank下载其序列,下载到全序列,你需要扩增的CDS区,也就是编码区,可以全外显子扩增,这样简单一点,也可以做cDNA克隆,然后再做,前者的话就可以直接根据其基因序