怎么设计引物扩增一段序列

直接发送给我,我帮你设计.

从NCBI中下载基因的序列,再用DNASTAR进行比对,那是保守区域!

合成的单链在实验时又一个和模板结合的退火过程,在这个过程中会自动形成茎环结构,如果你的茎环结构设计合理的话.我也在类似文献上看到过上游引物含有额外的碱基,上面有说明的,是为了调整Tm值.上游引物不能全

只能两头设计你不知道基因名字么实在不行拿序列去BLAST上比对下也能知道它前后是啥啦

用primerblast,输进去上下游,选好种属和扩增对象search不就出来了

试试吧.退火温度低一些50左右

把这段基因输入设计软件里,调节引物位置,使变性温度在94度,退火温度=Tm-（5到10度）延伸温度72度左右,满足这些条件基本就可以了,当然还要根据实际情况多次实验得到最佳引物.如果你要扩增整个的基因

一定要的.正向引物：5'.CTTCGAAATTC3'反向引物：5'.CCGATCGGGAGA3'回答楼主的补充问题：设计正向引物时,该引物序列应该具有和你待扩增DNA序列接近5‘段处的序列.反向引物设

若是根据已知序列扩增未知物种的相应序列,可以根据先根据已知序列进行Blast搜索,发现其他同源序列,保存后进行比对,找出其中较保守区域,并根据Primer或Oligo等软件对某条序列进行分析,搜索其中

前提：你的这条序列是5‘--3’的吧正向引物5‘--3’：TGCAACTACGTCCAC反向引物5‘--3’：TCGGACAAGACGTGC再问：能说说为什么吗？再答：DNA是双链的，引物结合于一条链

这问题都上百度知道来问了,你也是生物专业的研究生吧.PrimerPremier5这个软件设计引物用很不错的.

cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段.由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可.

首先请上NCBIBLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.若搜索不到任何信息,就需要通过设

首先请上NCBIBLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.若搜索不到任何信息,就需要通过设

上游引物：GAATTCacgcgcaagattagg（后面可以继续加几个碱基,用PRIMER5.0看一下,引物设计多少个碱基合适,每个基因序列不同.我用TOYOBO的KODPLUS的话,就一般引物设计

5':CGGAATTCACGCGCAAGATTAGGTGGGG3':CGGGATCCCCTTGGGAAGAAAAAGCAAG引物组成为：保护碱基+酶切位点+目的基因末端序列.由于你要扩增全部这段序列,

对于这种情况,如果你只是找不到扩增引物的序列,但是能找到后面所要扩增的序列的话,那么可能还是因为测序引物离你的扩增片断太近.如果不是这种情况,那么可能是你根本没有将扩增片断成功连入当然还有一种可能是公

引物长度和专一性常见的引物长度为18-30个碱基.短的引物（≤15碱基）能非常高效地结合,但是它们的专一性不够.较长的引物能提高专一性,然而退火效率低,从而导致PCR产量低下.同时应避免编码单一序列和

这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握

这个比较麻烦,如果你想用RACE的方法,3'末端需要添加上像真核生物那样的polyA尾巴,而且你要克隆它的全基因序列,还要做5'RACE.RACE技术比较适合真核生物.如果你要克隆的基