如何去锁定或初步筛选研究相关snp位点
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:综合作业 时间:2024/07/18 04:49:27
如何去锁定或初步筛选研究相关snp位点
这个要看研究的对象了
如果是单基因遗传,二代测序这个比较好做,特别是那种罕见遗传的疾病,可以通过外显子测序(因为罕见遗传病大部分都是外显子的突变造成的),对一个家系的几个个体进行测序,筛选低频突变,随后找那种能改变蛋白功能的突变,最后做共分离分析.如果是多基因病或者质量性状定位,那么2个方法,1,全基因组关联分析GWAS,用散发型个体,做关联分析.不过这种方法要的样本量比较大,一般都要大几百个,多的都要好几千.2.基因家系的连锁分析,这个主要是定位,然后在后续做一些东西,一般用芯片或者全基因组重测序或者简化基因组测序.
如果是单基因遗传,二代测序这个比较好做,特别是那种罕见遗传的疾病,可以通过外显子测序(因为罕见遗传病大部分都是外显子的突变造成的),对一个家系的几个个体进行测序,筛选低频突变,随后找那种能改变蛋白功能的突变,最后做共分离分析.如果是多基因病或者质量性状定位,那么2个方法,1,全基因组关联分析GWAS,用散发型个体,做关联分析.不过这种方法要的样本量比较大,一般都要大几百个,多的都要好几千.2.基因家系的连锁分析,这个主要是定位,然后在后续做一些东西,一般用芯片或者全基因组重测序或者简化基因组测序.
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