作业帮哪位好心人能帮我把这段DNA序列转变成蛋白质序列?
来源：学生作业帮 编辑：作业帮 分类：综合作业 时间：2024/09/14 23:29:02
哪位好心人能帮我把这段DNA序列转变成蛋白质序列?
DNA序列如下：TCACGCGTCGAATCGCGCGGCGACTCGATGAAATGGCCCGCGACGACGTCCCAATCCGCTTCCGCGCGCAGATCGGTGGTCTGCGCGGGCCAATGCTCGCGCGCTCGCGCGACGAACGCGGTGCGATAGGCCCAGCGCCGCGCGGGCAGGAGGTCGCCGTTGTGCGCGGCGACGAGGACACCCTCATCCGGACGCAGCGCGAGGATATCGGCCGTGCGCAGGTACGCTTCGGGCGTCGGCTTGTACGCCTGCGCCACCGTCGCGCCGAGGATCGCGTCCCACGGCAGCCAACGGCGCTTGGCCATGTCGATCATCAGGATCACGTTGCCGTTCGACAGCGGCGCGATGATGTAATGCGCCTTCAGCCGCGTGAGCCCCGCGACCGAATCGGGCCACGGATCGAGCCGGTGCCATGCGGGTATCAGCGCGTCGAGATCGGCGTCGGCCACGCTCGTGCGATCGATGCCGAACGCGGGCAGCAGCGCGTCGAGATTCTCCCGATGCAGAAGGTCGAGCCGCGTGAACGGCCGGCGGCCGCTGATGCCCTCCTCCATCGCGGGCGAATAGCCCGCGCGCCACGCATCCGCGAACGCGGCCGGATCGGCTCCCGCGCCGCCGTACTTCGCGAGGAACGGCGTCGCGTCGCGAATGACGCCGGAACGCCAGTCGACCACGGTGCCGAACACGTCGAATACCAATGCCTTCACGCCAAGCGTCTGCAT
我用Primer Premier 5.0翻译过来的是：
SRVESRGDSMKWPATTSQSASARRSVVCAGQCSRARATNAVR-AQRRAGRRSPLCAATRTPSSGRSARISAVRRYASGVGLYACATVAPRIASHGSQRRLAMSIIRITLPFDSGAMM-CAFSRVSPATESGHGSSRCHAGISASRSASATLVRSMPNAGSSASRFSRCRRSSRVNGRRPLMPSSIAGE-PARHASANAAGSAPAPPYFARNGVASRMTPERQSTTVPNTSNTNAFTPSVC
中间出现一些短横线“-”,结果拿去分析就无法分析.这是为什么?
PS:翻译出来了偶会给加分...
DNA序列如下：TCACGCGTCGAATCGCGCGGCGACTCGATGAAATGGCCCGCGACGACGTCCCAATCCGCTTCCGCGCGCAGATCGGTGGTCTGCGCGGGCCAATGCTCGCGCGCTCGCGCGACGAACGCGGTGCGATAGGCCCAGCGCCGCGCGGGCAGGAGGTCGCCGTTGTGCGCGGCGACGAGGACACCCTCATCCGGACGCAGCGCGAGGATATCGGCCGTGCGCAGGTACGCTTCGGGCGTCGGCTTGTACGCCTGCGCCACCGTCGCGCCGAGGATCGCGTCCCACGGCAGCCAACGGCGCTTGGCCATGTCGATCATCAGGATCACGTTGCCGTTCGACAGCGGCGCGATGATGTAATGCGCCTTCAGCCGCGTGAGCCCCGCGACCGAATCGGGCCACGGATCGAGCCGGTGCCATGCGGGTATCAGCGCGTCGAGATCGGCGTCGGCCACGCTCGTGCGATCGATGCCGAACGCGGGCAGCAGCGCGTCGAGATTCTCCCGATGCAGAAGGTCGAGCCGCGTGAACGGCCGGCGGCCGCTGATGCCCTCCTCCATCGCGGGCGAATAGCCCGCGCGCCACGCATCCGCGAACGCGGCCGGATCGGCTCCCGCGCCGCCGTACTTCGCGAGGAACGGCGTCGCGTCGCGAATGACGCCGGAACGCCAGTCGACCACGGTGCCGAACACGTCGAATACCAATGCCTTCACGCCAAGCGTCTGCAT
我用Primer Premier 5.0翻译过来的是：
SRVESRGDSMKWPATTSQSASARRSVVCAGQCSRARATNAVR-AQRRAGRRSPLCAATRTPSSGRSARISAVRRYASGVGLYACATVAPRIASHGSQRRLAMSIIRITLPFDSGAMM-CAFSRVSPATESGHGSSRCHAGISASRSASATLVRSMPNAGSSASRFSRCRRSSRVNGRRPLMPSSIAGE-PARHASANAAGSAPAPPYFARNGVASRMTPERQSTTVPNTSNTNAFTPSVC
中间出现一些短横线“-”,结果拿去分析就无法分析.这是为什么?
PS:翻译出来了偶会给加分...
依照第三个读码框翻译的结果是：
TRRIARRLDEMARDDVPIRFRAQIGGLRGPMLARSRDERGAIGPAPRGQEVAVVRGDEDTLIRTQREDIGRAQVRFGRRLVRLRHRRAEDRVPRQPTALGHVDHQDHVAVRQRRDDVMRLQPREPRDRIGPRIEPVPCGYQRVEIGVGHARAIDAERGQQRVEILPMQKVEPRERPAAADALLHRGRIARAPRIRERGRIGSRAAVLREERRRVANDAGTPVDHGAEHVEYQCLHAKRLH
再问： 请问您是通过怎样的途径翻译到的呀？
再答： 我又其他软件啊。我用的geneious软件把所有6个编码框都翻译出来看的。
再问： BLAST了一下，不知道哪出了差错，按道理应该能找到10个相似序列的，我只找到了三条
再答： 你的DNA序列是测序数据么？里面包含完整的ＯＲＦ还是非完整的ＯＲＦ？
再问： 其实，偶是小白。。。 我是在做一道题目，它给了那个DNA序列，要求检索与该蛋白序列相似的蛋白质序列并对它们进行多序列比对，构建该蛋白在原核生物中的分子进化系统树。。。
再答： 我觉得你先得把我的问题搞清楚...问问给你序列的人是个什么情况吧。
再问： 你的问题对偶来说还真有难度，呵呵……问老师估计他也不会说，毕竟是作业……我再看看吧
再答： 或者你直接做blastp，用DNA序列直接找蛋白序列啊。
再问： 在NCBI上找到了blastx、tblastn 、tblastx，木有找到blastp……T T
再答： 哦，说错了，忘了你给的是DNA序列了。是用tblastn。bilastp是蛋白质查蛋白质的。
TRRIARRLDEMARDDVPIRFRAQIGGLRGPMLARSRDERGAIGPAPRGQEVAVVRGDEDTLIRTQREDIGRAQVRFGRRLVRLRHRRAEDRVPRQPTALGHVDHQDHVAVRQRRDDVMRLQPREPRDRIGPRIEPVPCGYQRVEIGVGHARAIDAERGQQRVEILPMQKVEPRERPAAADALLHRGRIARAPRIRERGRIGSRAAVLREERRRVANDAGTPVDHGAEHVEYQCLHAKRLH
再问： 请问您是通过怎样的途径翻译到的呀？
再答： 我又其他软件啊。我用的geneious软件把所有6个编码框都翻译出来看的。
再问： BLAST了一下，不知道哪出了差错，按道理应该能找到10个相似序列的，我只找到了三条
再答： 你的DNA序列是测序数据么？里面包含完整的ＯＲＦ还是非完整的ＯＲＦ？
再问： 其实，偶是小白。。。 我是在做一道题目，它给了那个DNA序列，要求检索与该蛋白序列相似的蛋白质序列并对它们进行多序列比对，构建该蛋白在原核生物中的分子进化系统树。。。
再答： 我觉得你先得把我的问题搞清楚...问问给你序列的人是个什么情况吧。
再问： 你的问题对偶来说还真有难度，呵呵……问老师估计他也不会说，毕竟是作业……我再看看吧
再答： 或者你直接做blastp，用DNA序列直接找蛋白序列啊。
再问： 在NCBI上找到了blastx、tblastn 、tblastx，木有找到blastp……T T
再答： 哦，说错了，忘了你给的是DNA序列了。是用tblastn。bilastp是蛋白质查蛋白质的。