作业帮如何在NCBI上寻找要扩增的序列?
来源：学生作业帮 编辑：作业帮 分类：数学作业 时间：2024/07/05 23:26:05
如何在NCBI上寻找要扩增的序列?
我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下：1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的序列?据说这两个一个是模板链,一个是非模板链.2.该SNP是G 683 A...请问683是怎么数的?3.设计引物的时候是从SNP上下选取多少bp的碱基合适?100?还是500?
我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下：1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的序列?据说这两个一个是模板链,一个是非模板链.2.该SNP是G 683 A...请问683是怎么数的?3.设计引物的时候是从SNP上下选取多少bp的碱基合适?100?还是500?
博凌科为-为你回答之前,提醒你注意一个问题,那就是先要搞清楚gene的大致概念.一般而言,一个完整gene是有起始密码子和终止密码信息的,还有各种已知的其他预示结构,所以1.不管哪个序列,你能找到起始密码子及终止密码子,就是这条序列了.2.从这个gene的起始位置算喽3.选取的位置,没有绝对规矩.一方面取决上下游位置的保守情况,越保守越好,还取决pcr和测序情况,你擅长测2,300bp的序列呢,还是500以上的bp呢?回答完毕,得奖励楼!