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质粒提取,机器测得OD260/OD280=2.04,浓度780ug/mL,但是电泳检测没有条带

来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:生物作业 时间:2024/07/18 19:27:43
质粒提取,机器测得OD260/OD280=2.04,浓度780ug/mL,但是电泳检测没有条带
第一次用一步法试剂盒提取质粒,提取之后,机器测得OD260/OD280=2.04,浓度780ug/mL,但是电泳检测没有条带.marker和对照的dna能检测出条带.
估计有很多种可能,我简单说几种,你看看能不能对上号
一、电泳检测时的上样液浓度太大,导致的DNA无法进入胶体中.
1、通常是loading buffer中水分挥发掉了浓度太大,点样的时候会被枪头带出来,或者就是浓度大使得DNA无法进入琼脂糖凝胶,换loading buffer,或者加水.
2、样品中混有太多蛋白等杂质,阻碍DNA进入点样孔等.
二、RNA太多将染料全部结合掉了,导致DNA无法与EB或者核酸染料结合而无法被检测出,这个您可以将跑好的胶再染一遍色,就是泡在EB或者核酸染料稀释后的TEB中.
三、都降解了,你只说OD260/OD280=2.04,这个可能是DNA、RNA、dNTP、ddNTP,只要是含有那个环形的磷酸戊糖结构就能产生这样的吸收效果.
四、其他原因太多了,建议你先看看是不是上述原因吧,不行您再追问.
再问: 上样量是1uL,还有双酶切,单酶切的样,都没有条带,也看不到RNA与核算染料结合的情况,含有蛋白的概率不大,同样量的染料,刚提的质粒,不会全部降解
再答: 这张图片上看很明显你的成像仪设置有问题,先试着调节一下景深和焦距吧,左侧maker都几乎看不清了,带型也很糟糕,建议重新做一次电泳,这张片子即使是有条带也说明不了任何事,完全不清晰。 一般的这种情况下少于300ng的上样量估计都不会很明显,建议先重新配置电泳缓冲液,在TBE、TAE、TPE中首选TBE,电泳时的电压也不易超过2v/cm,制备的胶体请在4℃冰箱内凝固,时间不要超过20min,等解决了这些会是你电压检测的分辨率提高到25ng的上样量即可清晰检出。先解决了这些最基本的实验技术再查原因吧,否则真的很难分析了。 至于是不是含蛋白您证实了吗?其实很简单看看OD260/OD230的比值或者简单的做个酚氯仿抽提看看就好了,不知道您这个概率不大的根据,科研是严整的事。 完全降解这方面,您了放心,即使只是少量降解了,这张片子上看少于300ng的上样量肯定看不清了。查一下你的maker中最亮和最暗的条带的浓度,再乘以体积(通常2-5ul)计算一下就好了。